* Habitat -tap: Ødeleggelsen av Little Blue Penguin Habitat er en stor trussel for arten. Dette kan være forårsaket av en rekke faktorer, inkludert kystutvikling, forurensning og klimaendringer.
* sykdom: Små blå pingviner er utsatt for en rekke sykdommer, inkludert aviær kolera, aspergillose og koksidiose.
* Menneskelig interferens: Små blå pingviner kan forstyrres av menneskelige aktiviteter, for eksempel båtliv, fiske og svømming. Dette kan føre til stress, skade og til og med død.