For omtrent 358,9 millioner år siden. Her er noen mulige forklaringer på deres utryddelse:
Endring av klima: Den sene Devonian -perioden var en tid med betydelige klimaendringer. Jorden opplevde en serie isalder, som forårsaket svingninger i havnivået og endringer i marine miljøer. Dunkleosteus, som ble tilpasset varmere vann, kan ha kjempet for å overleve under de skiftende forholdene.
Konkurranse: Den sene Devonian -perioden så diversifiseringen og økningen av andre grupper av rovdyr, inkludert forskjellige arter av haier og benete fisker. Disse konkurrentene kan ha lagt press på Dunkleosteus 'matkilder og naturtyper.
Overfiske: Dunkleosteus var et topp rovdyr, men det kan også ha blitt offer for overfiske av andre marine rovdyr. Noen forskere antyder at det økende mangfoldet og overflod av andre rovdyr kunne ha bidratt til Dunkleosteus 'tilbakegang.
sykdom: Sykdomsutbrudd eller andre helseutfordringer kunne også ha påvirket overlevelsen av Dunkleosteus -populasjoner. Imidlertid er det begrenset informasjon om spesifikke sykdommer eller patogener som kan ha spilt en rolle i deres utryddelse.
Kombinasjon av faktorer: Det er sannsynlig at en kombinasjon av de ovennevnte faktorene, sammen med andre ukjente miljøendringer, til slutt førte til utryddelse av Dunkleosteus. Den spesifikke sekvensen og relative bidrag fra disse faktorene er fremdeles gjenstander for forskning og debatt blant paleontologer.