Blåhvaler står overfor naturmessige utfordringer som tilgjengelighet av mat, rovdyre på kalver, klimaendringer og sykdom. Menneskeskapte trusler inkluderer skipskollisjoner, redskap i fiskeutstyr, støyforurensing og livsmiljøforstyrrelse.
Vernarbeid som internasjonale avtaler, marine verneområder, forskning og offentlig oppmerksomhet har som mål å beskytte disse majestetiske skapninger for fremtidige generasjoner.