Rovdyre for Weddell-sel
- Leopard-sel: Den primære rovdyret; sterkt, smidig og formidabelt jakte.
- Spekkhvaler (killer whales): Mindre vanlige, men i stand til å rovdykte voksne Weddell-seler.
- Isbjørner: Jaktes av og til på ungar og unge seler.
- Andre Weddell-seler: Kanibalisme observeres noen ganger, spesielt under knaushet.
Menneskelig-relaterte trusler
- Klimaendringer: Smeltende havis truer parnings- og fødselsområder.
- Fiskeredskaps-hette: Nett og utstyr kan forårsake skade eller død.
- Forurensning: Oljeutslipp og andre forurensninger skader seler og deres miljø.
- Jakt: Regulert i noen områder, men fortsatt en potensiell trussel.
Andre faktorer
Sykdom, parasitære infeksjoner, og konkurranse med pingviner og andre seler om mat og parningsområder påvirker også Weddell-seler. Spesifikke trusler varierer med lokasjon og sesong.