1. Livraumtap
Den mest signifikante faktoren som bidrar til den mexicanske ulvens trussel er livraumtap. Dette skyldes i stor grad omdanning av naturlige livraumer til jordbruks- og urbanområder. Som et resultat har de mexicanske ulvene mistet tilgang til sitt naturlige byttedyr og egnete hiområder.
2. Jakt og felling
Historisk sett ble de mexicanske ulvene jaktet og fanget for sitt pels og som middel for rovdyrkontroll. Dette wahlløse drep av ulver reduserte bestander ytterligere.
3. Hybrisering
De mexicanske ulvene er nært slektet med kojoter, og krysning mellom de to artene er dokumentert. Hybrisering kan føre til utvanning av den mexicanske ulvens genetiske integritet og tap av unike tilpasninger som er essensielle for overlevelse i sitt naturlige miljø.