Imidlertid visse populasjoner av pensel-tailed rotte-kangaroos kan møte trusler, for eksempel:
* Habitat -tap og fragmentering: Rydding av skoger og skogsområder for landbruk, urbanisering og annen landbruk ødelegger deres naturlige habitat.
* predasjon av introduserte arter: Rovdyr som vildkatter og rever kan ha betydelig innvirkning på befolkningen.
* Klimaendringer: Endringer i nedbørsmønstre og økt bushfirefrekvens kan true deres habitat og matkilder.
Det er viktig å merke seg at selv om arten som helhet ikke er truet, kan spesifikke populasjoner møte utfordringer som krever bevaringsinnsats.