Spindelapeur blir primært jaktet av store katter og rovfugler.
Jaguarer, pumaer, oselotter og mindre katter kan jakte dem. Harpyieørn er kjent for å jakte spindelapeur. Store slanger som boakonstrictorer og anakondaer kan rikte seg mot unge aper.
Spindelapeur er smidige og lever i beskytende sosiale grupper, noe som gjør dem til vanskelig bytte for de fleste rovdyrene.