Nosapekonger har ikke mange naturlige fiender på grunn av sin størrelse og levested. Likevel er det enkelte trusler de står overfor:
Rovdyr:
Krokodiller: Nosapekonger er sårbare for krokodiller i og rundt sine sumplevesteder.
Store slanger: Større slanger, som pythons, kan utgjøre en trussel mot unge eller mindre nosapekonger.
Leopardkatter: Disse små, smidige kattene er oportunistiske rovdyre og kan rovde unge eller sårbare nosapekonger.
Rovfugler: Store ørner og høker kan potensielt rovde spedbarn eller små nosapekonger.
Andre trusler:
Mennesker: Habitatstap pga. skogavvirkning, jakt for busjkjøtt og kjæledyrhandel er betydelige trusler mot nosapekonger.
Sykdommer: Nosapekonger er mottagelige for sykdommer som veslefeber og parasitter.
Det er viktig å merke seg at nosapekonger har et naturlig forsvar, nemlig evnen til å svømme. Dette hjelper dem å rømme fra rovdyre i sine sumplevesteder. Likevel utgjør menneskelig aktivitet den mest betydelige trusselen mot deres overlevelse.