* antall kromosomer: Mennesker har 23 par kromosomer, mens de fleste aper har 24 par.
* DNA -sekvens: DNA -sekvensene til mennesker og aper er omtrent 98% identiske. Imidlertid utgjør 2% forskjellen for millioner av individuelle genetiske variasjoner.
* Geninnhold: Mennesker og aper har et lignende antall gener, men noen gener har forskjellige funksjoner i hver art. For eksempel er et gen som er involvert i tale- og språkutvikling hos mennesker ikke til stede hos aper.
* Reguleringsregioner: Reguleringsregioner kontrollerer når og hvor gener er uttrykt. Disse regionene er ofte forskjellige mellom mennesker og aper, noe som kan føre til forskjeller i genuttrykksmønstre.
Forskjellene mellom menneskelige og apegenomer har implikasjoner for vår forståelse av menneskelig evolusjon, helse og atferd. Ved å studere disse forskjellene kan forskere få innsikt i de biologiske mekanismene som har formet menneskelig evolusjon og som bidrar til våre unike egenskaper som art.