Den aviane epifysen regulerer flere essensielle biologiske funksjoner.
Sirkadiansk ryme og fotoperiodisme
Kjertelen hjelper med å regulere sirkadiane rythmer og respons på dagslengde. Den mottar dagslysinformasjon gjennom øynene og justerer kroppens indre klokke for å koordinere fysiologien med sesongene.
Melatoninproduksjon
En av dens nøkkelroller er å produsere og utskille melatonin, som regulerer søvn-våken-sykluser og frigjøres som respons på mørke.
Sesongmessig reproduksjon
Hos mange arter kontrollerer epifysen reproduktiv aktivitet basert på sesongmessige lyssignal, som påvirker hormoner som gonadotropin-frigjørende hormon.
Trekking
Kjertelen kan hjelpe med å prosessere miljøsignal for trekking, inkludert himmelsknavigasjon og magnetfelt.
Spesifikke funksjoner kan variere mellom arter, og forskning på aviansk epifysefysiologi pågår.