Fluer gir positive bidrag til økosystemer:
- Pollinering: Mange fluer, inkludert blomsterfluer og sivirfluer, overfører pollin mellom blomster mens de spiser nektar og pollin, og støtter plantereproduksjon og genetisk mangfold.
- Frøspredning: Noen fruktfluer inntar frø som passerer fordøyelsessystemet uskadd, og spreder dem gjennom avføring.
- Biodiversitet: Fluer serverer som mat for fugler, edderkopper, reptiler, amfibier, og opprettholder næringsskjærer.
- Næringsstoffsyklus: Som nedbrytere bryter fluer ned dødt organisk materiale og returnerer næringsstoffer til miljøet.
- Biologisk kontroll: Noen fluer parasitterer eller predaterer skadeinsekter i jordbruk.
- Medisinsk og vitenskapelig forskning: Fruktfluer er modellorganismer i genetikk og biologisk forskning.
Ikke alle fluer er gunstige; noen er skadedyr eller sykdomsbærere, så riktig skadedyrkontroll er viktig.