plantevernmidler :Plantevernmidler som brukes til å kontrollere gnagere og andre skadedyr kan også forgifte præriehunder.
sykdommer :Prairiehunder er utsatt for forskjellige sykdommer, inkludert sylvatisk pest, tularemia og hjørnetann. Disse sykdommene kan spre seg blant præriehundekolonier og forårsake nedgang i befolkningen.
jakt :I noen områder jages præriehunder etter sport eller for å beskytte husdyr.
predasjon :Prairiehunder blir byttet av forskjellige rovdyr, inkludert coyoter, ulver, rever og rovfugler.
På grunn av disse faktorene er flere præriehundarter oppført som truet eller truet under loven om truede arter. Bevaringsinnsats pågår for å beskytte deres naturtyper og håndtere trusler mot befolkningen.