Et ørkenøkosystem er en type økosystem som kjennetegnes av mangel på vann. Ørkener finnes i mange deler av verden, inkludert Sahara-ørkenen i Afrika, den arabiske ørkenen i Midtøsten, og Atacama-ørkenen i Sør-Amerika. Ørkener er typisk varme og tørre, med svært lite nedbør. Mangel på vann gjør det vanskelig for planter og dyr å overleve i ørkener, men noen arter har tilpasset seg disse forholdene.
Ørkenplanter har ofte tykke blader og stengler som hjelper dem å lagre vann. Ørkendyr har ofte lange bein som hjelper dem å bevege seg raskt over sanden. Ørkener er viktige økosystemer fordi de gir livsmiljø for en rekke planter og dyr. Ørkener spiller også en rolle i det globale klimaet ved å absorbere varme og frigjøre den sakte.