Å sykle (cycle) et nytt akvarium etablerer den biologiske filteren (nitrogen-syklusen) før fisk legges i. Nyttebakterier koloniserer filtermedia og substrat, og omsetter giftig ammoniak (fra avføring/matrester) → nitritt (giftig) → nitrat (mindre giftig). Uten sykling bygger seg ammoniak/nitritt opp raskt og dreper fisk. Prosessen tar 2–6 uker; overvåk med testsett. «Fisk-løs sykling» (ammoniak-tilførsel) er humanere enn å bruke hardy fisk.