Her er grunnen:
* Morfologiske likheter: Choanoflagellates deler påfallende likheter med kragecellene (choanocytter) som finnes i svamper, de enkleste dyrene. Begge har et enkelt flagellum omgitt av en krage med mikrovilli, som brukes til å filtrere mat fra vannet.
* Genetisk bevis: Molekylær analyse, spesielt av ribosomale RNA -gener, støtter sterkt det nære evolusjonsforholdet mellom choanoflagellates og dyr. De deler et unikt sett med gener som ikke finnes i andre protister.
* Potensiell stamfar: Det antas mye at en choanoflagellatlignende stamfar ga opphav til dyr.
Mens andre protister, for eksempel amoebozoene, har blitt antydet å være nært beslektet med dyr i fortiden, peker bevisene overveldende på choanoflagellates som de nærmeste levende slektninger.