Tap og fragmentering av habitat :Jaguarer krever omfattende territorier og forskjellige habitater for å overleve. Dessverre går deres naturlige habitater raskt tapt og fragmentert på grunn av avskoging, utvidelse av landbruket, utvikling av infrastruktur og byvekst. Dette reduserer ikke bare den tilgjengelige plassen for jaguarer å streife omkring, men forstyrrer også avl-, fôrings- og migrasjonsmønstrene deres.
Konflikt mellom mennesker og dyreliv :Når menneskelige bosetninger utvides til jaguarhabitater, oppstår konflikter når jaguarer forgriper seg på husdyr. Dette kan føre til gjengjeldelse fra bønder og ranchere, noe som resulterer i drap av jaguarer. I tillegg kan jaguarer bli drept hvis de utgjør en trussel mot menneskers sikkerhet eller blir sett på som en plage.
Klimaendringer :Effektene av klimaendringer, som endrede nedbørsmønstre, stigende temperaturer og økt hyppighet av ekstreme værhendelser, påvirker jaguarhabitater og byttedyrbestander. Disse endringene forstyrrer økosystemet og gjør det mer utfordrende for jaguarer å overleve og reprodusere seg vellykket.
Begrenset genetisk mangfold :Jaguarer har relativt lavt genetisk mangfold sammenlignet med andre store kattearter. Dette gjør dem mer sårbare for virkningene av tap av habitat, jakt og andre faktorer som kan forstyrre populasjonene deres. Lavt genetisk mangfold kan redusere artens evne til å tilpasse seg miljøendringer og øke risikoen for innavl.