Den viktigste årsaken til maiskrakens tilbakegang er tap og fragmentering av habitat. Maiskrekker foretrekker tette enger med høy vegetasjon og høy luftfuktighet. Imidlertid går disse naturtypene i økende grad tapt på grunn av intensivering og urbanisering av landbruket.
plantevernmidler og ugressmidler
Plantevernmidler og ugressmidler kan også skade maiskrekker og deres matkilder. Plantevernmidler kan direkte drepe maiskrekker ved å forgifte dem eller skade deres reproduktive organer. Ugressmidler kan redusere mengden vegetasjon som er tilgjengelig for maiskrekker å hekke og fôre inn.
rovdyr
Rovdyr, som rever, stoater og katter, kan også ta en toll på maiskrakebestander. Corncrake Chicks er spesielt utsatt for predasjon, da de ikke er i stand til å fly de første ukene av livet.
Klimaendringer
Klimaendringer er også en trussel mot maiskraken. Når klimaet blir varmere og tørrere, blir maiskrakens foretrukne habitat mindre vanlig. I tillegg får klimaendringene på at maiscrakes trekkmønstre endres, noe som kan forstyrre avlssyklusene deres.