Truede arter
Flere dyrearter i Sequoia nasjonalpark er føderalt listet som truede, inkludert sørsierra Nevada-fisker, Sierra Nevada-røvrev og California-kondor.
Sårbare arter
Parken er også hjem for sårbare arter som stor Kranich og vestlig gulnebb-koelkjegle.
Sierra Nevada-rødrev
En av parkens mest karismatiske truede arter, Sierra Nevada-rødreven er tilpasset høytliggende skoger og er avhengig av tett vegetasjon for dekning og oppdratt av unger. Habitattap og fragmentering fra hogst, utvikling og brannundertrykking har bidratt til nedgangen. I dag anslås færre enn 500 individer å være igjen.
California-kondor
California-kondoren, det største flyvende landfuglet i Nord-Amerika med en vingeavstand på opptil 9 fot, er en annen truett art i parken. En gang erklært utdødd i villmarken på 1980-tallet, har kondorer blitt reintroduksjonert gjennom et vellykket oppdrettsprogram. Mer enn 500 lever nå i villmarken.
Verninnsats
Sequoia nasjonalpark samarbeider med U.S. Fish and Wildlife Service, California Department of Fish and Wildlife og bevaringsorganisasjoner for å overvåke og beskytte disse artene. Tiltak inkluderer habitatgjenoppretting, kontroll av fremmede arter, redusering av menneske-villmarkskonflikter og offentlig opplæring.