Selv om svarte kaimaner er toppredatorer i sitt miljø, har de noen rovdyr, selv om det er få:
- Større kaimaner: Voksne svarte kaimaner kan bli byttedyr for større artsfeller.
- Jaguarer: Kjent for å av og til jakte voksne svarte kaimaner.
- Anakondaer: Store grønne anakondaer har vist å drepe og spise voksne svarte kaimaner.
- Mennesker: Offer for brytning for skinn og kjøtt.
Rovdyrskap på voksne svarte kaimaner er relativt sjelden da de er sterke og velutrustet til å forsvare seg.