Jaguare er truet av flere menneskeskapte faktorer:
- Habitattap: Regnskoger, sumper og gressletter rydes for jordbruk, hogst, gruvedrift og utvikling.
- Jakt og ulovlig jakt: Jaguare drepes for pels og i hevn for rovdyreangrep på husdyr.
- Vilthandel: De fanges og selges som ekotiske kjæledyr eller for tradisjonell medisin.
- Menneskekonflikt: Rovdyreangrep på husdyr fører til dreping eller habitatendring.
- Begrenset genetisk mangfold: Tidligere genetiske flasjehalser gjør dem mer sårbare for sykdom og miljøendringer.
- Byttedyrnedgang: Overjakt av byttedyr reduserer mattetilgjengelighet.
Bråte bevaringstiltak er nødvendige for å beskytte jaguare og deres habitater.