Gjøkøgle står overfor flere trusler:
- Habitattap: Jordbruk og urban ekspansjon har redusert og fragmentert deres utbredelsesområde.
- Ulovlig jakt og bracting: Jaktet for kjøtt, hud, tradisjonell medisin og kjæledyrhandel.
- Klimaendringer: Endrer temperatur, nedbør, mattilgang og hekkesesonger.
- Rovdyr og konkurranse: Fjernete katter og rever rovdykker dem; andre rovdyer konkurrerer om mat.
- Utilstrekkelig juridisk beskyttelse: Begrenset håndhevelse gjør dem sårbare for utsetting.