Årsak
De korte lemmer på Munchkin-katten skyldes en dominant genetisk mutasjon som oppstår spontant i genpoolen og påvirker kun kattenes bein, ifølge The Dwarf Cat Association. Den autosomale (ikke kjønnskromosom) dominante «munchkin-genen» arves fra forelder til avkom, og resulterer i hypochondroplasi (en form for kortbent dværgvekst) hos noen unger.
Genetikk
Munchkin-katter er heterozygote, de har én «munchkin-gen» og én normal gen i sitt genetiske oppsett. Ikke-levedyktige embryoer mottar to «munchkin-gener» (homozygote) og går under i livmor eller straks etter fødsel. Kryssing av Munchkin med andre Munchkin eller normale katter kan også gi normale katter (homozygote for normale gener).
Vurderinger
Munchkin-katter fungerer like bra som normale katter, men rasen er benet for lordose, en nedoverbøying av ryggmarven som komprimerer hjerte og lunger, og pectus excavatum, som også påvirker brystkassen. Katter med disse sykdommene bør ikke oppdres da de kan arve egenskapen til avkom.