Sårbare biotoper er økosystemer som er særlig sårbare for negative effekter av menneskelig aktivitet. Begrepet refererer generelt til biotoper som er høyt tilpasset spesifikke miljøforhold, noe som gjør dem i økt risiko for forstyrrelse fra endringer i omgivelsene. Eksempler inkluderer korallrev, våtmarker, regnskoger, arktisk tundra og visse akvatiske miljøer som elvemynninger og marsjer. Deres sårbarhet stammer ofte fra høye nivåer av endemisme, spesialiserte tilpasninger, smale miljøtoleranser eller kritiske roller i økologiske prosesser.