Sjøhester er sensitive for en rekke ikke-levende miljøfaktorer:
Temperatur: Som ekotermer, er sjøhester avhengige av omgivelsene for å regulere kroppstemperatur og er mest aktive i varme farvann.
Salinitet: De foretrekker nærmere havvanns-salinitet og kan stresses eller drepes av bratte endringer.
pH: Sjøhester trives best ved nøytral pH og er sårbare for raske pH-endringer.
Oksygen-nivåer: De krever veloksygenert vann og kan lide av langvarig lav-oksygen-eksponering.
Lys: De er generelt mer aktive om dagen og foretrekker vellyste habitater.
Substrat: De forankrer seg med halen og foretrekker tette opphold som korallgrus, tangeng og makroalger.
Forurensning: Olje, avløp og plast kan skade sjøhester og degraderer deres habitater.