DNA, eller desoksyribonukleinsyre, består av genetisk kode. Denne genetiske koden vil bestemme det fysiske utseendet av en person eller et dyr, som en hest. Fremskritt i DNA-testteknologi har gjort det mulig å bestemme DNA via et hårprøve. DNA kan finnes på enhver kroppsvev, inkludert lett å samle hår. Så få som 30 hårstråner kan brukes til DNA-testing, så lenge roten av håret er intakt.
DNA-profil
En heste DNA-profil kalles noen ganger enten genotyping eller et DNA-avtrykk. Denne profilen består av en spesifikk genetisk kode, unik for den individuelle hesten som testes. Hesten vil ha to sett gener, ett fra hver av foreldrene sine. DNA-profilen til en hest er i utgangspunktet en kombinasjon av de to DNA-profilene som ble arvet fra hver forelder.
Foreldreskap
DNA-profiler fra både hingst-paternal bidragsyter og sto-maternal bidragsyter (far og mor) vil bestemme foreldreskapet til hesten. Disse profilene må verifiseres. Nøyaktighet er så høy som 99,9 % med verifiserte profiler. Ved hårtesting, finnes DNA i hårfollikler, og DNA består av alle hestens kromosomer. Det er 12 genmarkører som trengs å testes for å profilere hesten, og hver av markørene inneholder ett gen for hver forelder. Hver av disse genene matche far og mor for å avgjøre om de faktisk er hestens foreldre.
Alleler
Delar av en hests DNA kalles alleler. Når de forskjellige markørene til en hest analyseres av en genetisk analyzer, bestemmes allelene til å være enten homozygote eller heterozygote. Alleler av samme størrelse er homozygote, noe som betyr at hesten har to identiske alleler, en fra hver forelder. Alleler av ulike størrelse er heterozygote, noe som betyr at hesten har to alleler av ulike størrelser fra hver forelder. Alleler kalles også bånd og alle alleler er kategorisert basert på deres individuelle størrelser.
Eksklusjon
Når man tester hester for foreldreskap, brukes eksklusjonsmetoden oftest. Hestens DNA-profil, eller genotyp, sammenlignes med DNA-profilene til både mor og far. Eventuelle alleler som finnes i hesten men som ikke finnes i mors DNA, antas å være fra fars DNA-profil.