En biodome trenger nøye utvalgte planter, dyr og habitater som kan trives i et kontrollert miljø samtidig som økologisk balanse opprettholdes.
Planter
Tropiske regnskogsplanter som orkideer, bromeliar, furuer, og philodendroner; tempererte skogsplanter som ek, lønn, og ville blomster; tørre ørkenplanter som kaktusser og sukkulenter; alpine tundraplanter som mose og laver; og akvatiske planter inkludert vannliljer og lotus.
Dyr
Insekter og wirbelløse dyr som sommerfugler, bier, og sniler; reptiler og amfibier som slanger, øgler, frosker, og skilpadder; tropiske og tempererte fugler; små pattedyr som aber, lemurer, ekorn, og kaniner; og fisk for akvatiske områder.
Habitater
Regnskog, løvskog, ørken, alpint, akvatisk, savanne, og nattlige soner kan simuleres for å støtte diverse arter og naturlige sykluser.
Biodiversitet bør planlegges for å etterligne interavhengigheten funnet i naturlige økosystemer.