Sjøhester finnes i et bredt spekter av vanntemperaturer, fra tropisk til temperert. Imidlertid foretrekker de fleste arter vanntemperaturer mellom 68 og 77 grader Fahrenheit.
I tropiske farvann finnes ofte sjøhester i grunt vann nær kysten. I tempererte farvann finnes de ofte i dypere vann, nærmere bunnen.
saltholdighet
Sjøhester finnes i et bredt spekter av saltholdighet, fra brakk til full marine. Imidlertid foretrekker de fleste arter saltholdighet mellom 30 og 35 deler per tusen.
I brakkvann finnes ofte sjøhester i elvemunninger og mangrove -sumper. I full marint vann finnes de ofte i korallrev og sjøgrasbed.
pH
Sjøhester finnes i et bredt spekter av pH -nivåer, fra surt til alkalisk. Imidlertid foretrekker de fleste arter pH -nivåer mellom 8 og 8,5.
underlag
Sjøhester finnes på en rekke underlag, inkludert sand, gjørme, stein og korall. Imidlertid foretrekker de fleste arter underlag som er dekket i vegetasjon.
I sand eller gjørmete naturtyper begraver sjøhester seg ofte i underlaget for å kamuflere seg fra rovdyr. I steinete eller korallhabitater bruker de ofte sin prehensile hale for å forankre seg til underlaget.
lys
Sjøhester finnes i et bredt spekter av lysnivåer, fra sterkt sollys til fullstendig mørke. Imidlertid foretrekker de fleste arter moderate lysnivåer.
I sterkt sollys finnes ofte sjøhester på grunt vann der de kan få rikelig med sollys til fotosyntese. I fullstendig mørke finnes de ofte i dypt vann der de kan unngå rovdyr.
strøm
Sjøhester finnes i et bredt spekter av nåværende styrker, fra stille vann til sterke strømmer. Imidlertid foretrekker de fleste arter moderate strømmer.
I stille vann finnes ofte sjøhester i skjermede områder som bukter og elvemunninger. I sterke strømmer finnes de ofte i områder med mye turbulens, for eksempel korallrev og tare skoger.