Morgan-hester finnes ikke naturlig i et spesifikt «habitat» i vildmarken som noen andre hesteraser. De er en tamet rase som oppstod i USA.
Likevel er de kjent for å trives i en rekke miljøer, inkludert:
- Beitemarker: Morgan-hester holdes ofte på beitemark med tilgang til ferskvann og god grazing.
- Staller: De kan stå i staller for en del av dagen eller natten, spesielt i kaldere klima eller når de må skilles fra andre hester.
- Gårder: Morgan-hester finnes ofte på gårder der de brukes til ulike formål, som riding, kjøring, og utstilling.
- Rancher: De kan også finnes på ranchere, der de brukes til å jobbe med storfe og andre husdyr.
I Endeffekt er deres «habitat» bestemt av eierne deres og formålet de holdes for.