Filippinene er hjemsted for flere truerte reptiler, inkludert:
- Filippinsk krokodille (Crocodylus mindorensis)
- Sjøkrokodille (C. porosus)
- Filippinsk øgle (Varanus olivaceus)
- Visayan vartete øgle (V. bitatawa)
- Filippinsk skogsskilpadde (Siebenrockiella leytensis)
- Grønn sjøskilpadde (Chelonia mydas)
- Hawksbill-skilpadde (Eretmochelys imbricata)
- Olive Ridley-skilpadde (Lepidochelys olivacea)
- Lærskilpadde (Dermochelys coriacea)
- Filippinsk taktskilt skilpadde (Kachuga mindorensis)