Koi (noen ganger kalt «coy fish») kan ha en rekke øyefarger, mest vanlig:
- Svart
- Gull
- Rød
- Hvit
Noen koi har flerfargede øyne, som svart med gullspreng eller røde med hvite iris. Øyefarge er ikke et definerende kjennetegn for koi-varianter; skjell og mønstre er viktigere.