Regnbueørret står overfor mange trusler i vill tilstand:
Rovdyre
- Større fisk: Ørret, gedde, abbør, sandart, og nordisk gedde predatorer på regnbueørret.
- Fugler: Fiskeørn, ørner, og hegre snupper ørret fra overflaten.
- Pattedyr: Oter, mink, og vaskebjørn jakter i grunne farvann.
Andre trusler
- Konkurranse: Andre fisk konkurrerer om mat og ressurser.
- Sykdom: Svekker immunforsvaret og øker sårbarhet.
- Miljømessige faktorer: Forurensing, habitatforstyrrelse, og klimaendringer reduserer vannkvalitet og matoverflod.
Menneskelige trusler
- Overfiske: Ubærekraftige praksiser utarmer bestander.
- Habitatforstyrrelse: Utbygging og forurensing ødelegger gyteområder.
Spesifikke fiender varierer med lokasjon og miljøforhold.