Hvis megalodon fortsatt eksisterte, ville dets tilstedeværelse vesentlig endre marine økosystemer. Som et toppredator ville det forstyrre næringskjeder, potensielt konkurrere med eller rovde på spækhuggere og hvithaier. Bestander av hvaler, sel og andre store marin dyr kunne avta, påvirke næringssykluser og biologisk mangfold. Noe arter kunne endre atferd og utbredelse for å unngå rovdrift. Megalodon kunne også påvirke økoturisme, kommersielt fiske og kystsikkerhet. Vitenskapsmenn ville sannsynligvis studere det grundig for å forstå dets biologi og økologiske rolle. Dette er hypotetiske scenarioer, da det ikke finnes bevis for at megalodoner eksisterer i dag.