Bløtdyr er blant de mest tilpasningsevne skapningene på jorden, og beboer nesten enhver akvatisk og terrestrisk miljø man kan tenke seg.
Akvatiske habitater
Marint: Majoriteten av bløtdyr lever i havet.
* Sjøstrandssone: Snigler, blåskjell, og sandskjell klyver seg til steiner eller graver seg i sand mellom flod og fjær.
* Grunnvann: Korallrev, tare-skoger, og tangmarker er hjem for utallige snigler, blekksprut, og oktopus.
* Dypvann: Skapninger som kjempeblekksprut bebor de mørke, kolde havdybdene.
Ferskvann: Elver, innsjøer, og dammer er hjem for ferskvannssnigler, muslinger, og sandskjell.
Brackvann: Elvemynninger, der ferskvann møter saltvann, støtter også bløtdyrspopulasjoner.
Terrestriske habitater
Land: Snegler og landsnigler har tilpasset seg liv på land, og foretrekker fuktige miljøer som skoger, hager, og undersiden av stubber.
Fra de dypeste havgropene til fjellskoger, viser bløtdyr bemerkelsesverdig tilpasningsevne og kan finnes i nesten hvert hjørne av verden.