Massachusetts er en relativt liten delstat, men den har likevel store områder med naturlig habitat som støtter mange plante- og dyrearter. Den er hjem for 31 truede dyrearter, og ytterligere 15 er listet som truet. Disse artene har ofte blitt påvirket av miljø- og habitatendringer, og i noen tilfeller har jakt redusert antall.
Fugler og pattedyr
- Massachusetts er hjem for 12 truede fuglearter og ytterligere seks som er truet. Blant de truede artene er havørn, vandrefalk, amerikansk rørsump, heilo og kortørt ugled. Delstatens truete arter inkluderer langørt ugled, konge rørsump, northern harrier og vesperspurv. Bare ett av delstatens landpattedyr er for øyeblikket truet, Indiana Myotis flaggermus, som på grunn av oversvømmelse av grottereder og menneskelig inngripen har hatt alvorlig bestandsnedgang.
Fisk
- Delstaten er hjem for fire truede fiskearter, to av dem lever hovedsakelig i havet men bruker vannveiene i Massachusetts til å gyte. Shortnose og Atlantic Sturgeons gyter begge i delstatens elver og påvirkes av damming av disse vannveiene. De to andre truede fiskene er Lake Chub og Red-Belly Dace, begge påvirket av forurensning og omledning av elver for jordbruk. American Brook Lamprey og Threespine Stickleback er begge ansett som truet i delstaten.
Reptiler og amfibier
- I Massachusetts er to skilpaddearter truede: myrskilpadde og Northern Red-Bellied Cooter. Blanding's Turtle og Diamond-Backed Terrapin er begge listet som truet. Tre av delstatens slangearter er truede, to av dem er giftige. Kobberhogg og Timber Rattlesnake er truede, så vel som den ikke-giftige Eastern Ratsnake. Eastern Wormsnake er listet som truet i delstaten. De fleste av Massachusetts' amfibiearter er trygge bortsett fra Marbled Salamander og Eastern Spadefoot Toad, som begge anses som truet.
Oceaniske arter
- Selv om de ikke er fastboende, er ni oceaniske arter beskyttet ved lov i delstaten og listet som truede. Seks hvalarter som migrerer gjennom delstatens kystvann er beskyttet: spermhval, finnhval, seihval, blåhval, pukkelhval og northern right whale. Tre skilpaddearter er også beskyttet under delstatsloven. De er havskilpadde, kemps ridley-skilpadde og læreskilpadde. Loggerhead og grønn skilpadde anses som truet i delstatens kystvann.