Det er vanskelig å navngi det enkelte sjeldneste dyret i Spania, da det ikke finnes en omfattende oversikt og noen arter er mer vanskelig å observere enn andre. Likevel fremstår flere kandidater:
* Iberisk gaupe (Iberian Lynx): Med ca. 100 individer er denne kritisk truede katten en av de sjeldneste i verden.
* Spansk keilerørn (Spanish Imperial Eagle): Truet av habitattap og jakt, populasjonen er liten.
* Iberisk desman (Iberian Desman): Et lite, semi-akvatisk pattedyr kun funnet på Iberia, kritisk truet pga. forurensning og habitatforringelse.
* Middelhavsmunkssel (Mediterranean Monk Seal): Kritisk truet og sjeldent sett i spanske farvann, med få individer igjen i Middelhavet.
* Iberisk vegghagehage (Iberian Wall Lizard): Anses som sårbar pga. habitatforstyrrelse og fremmede arter.
Alle disse dyrene står overfor store trusler, noe som gjør bevaringsinnsatser avgjørende for deres overlevelse.