Over tid begynte visse prosimiske befolkninger å utvise mer spesialiserte tilpasninger for livet i trærne. Disse tilpasningene inkluderte utvikling av motsatte tommelen, kikkertsynet og forbedrede kognitive evner. Disse endringene ga etter hvert opphav til de første sanne apene.
De tidligste kjente ape-fossilene dateres tilbake for rundt 40-50 millioner år siden og finnes i Afrika og Asia. Disse tidlige apene var små og arboreale, noe som betyr at de tilbrakte mesteparten av tiden sin i trær. Da de fortsatte å utvikle seg, diversifiserte apene seg til forskjellige arter og begynte å spre seg til andre deler av verden, inkludert Sør -Amerika.
Den mest mangfoldige gruppen av aper i dag finnes i den nye verdenen, som inkluderer Mellom- og Sør -Amerika. Nye verdens aper er preget av brede nesebor, prehensile haler (i noen arter), og mangel på kinnposer. Noen kjente aper i New World inkluderer Capuchin-aper, edderkopp-aper og Howler-aper.
Derimot finnes aper fra Old World i Afrika og Asia. De har smale nesebor, ikke-forebyggende haler og kinnposer for lagring av mat. Old World -aper inkluderer blant andre bavianer, makaker og Colobus -aper.
I løpet av millioner av år utviklet aper seg til en rekke arter med forskjellige fysiske egenskaper og atferd, og tilpasset seg forskjellige naturtyper og økologiske nisjer. De spilte en betydelig rolle i primatlinjen, og til slutt førte til utviklingen av mennesker.