Spindelaper er en del av familien Atelidae, som inkluderer alle Nyverdens-aper med grepbare haler. Innenfor Atelidae tilhører de underfamilien Atelinae, sammen med:
- Brølapner: Kjent for høye, bommende rop.
- Ullaper: Kjenneglagende ved sitt lange, tykke, fluffete pels.
- Muriquier: De største Nyverdens-aper, kjent for sin fredlige natur.
Kort sagt, spindelapenes nærmeste slektninger er de andre apene innenfor Atelinae-underfamilien.