Den mest bemerkelsesverdige egenskapen ved flaggermus er deres evne til å fly. Flaggermus er de eneste pattedyr som er i stande til opprettholdt, motorisert flyvning. Deres forelimber er modifisert til vinger, med forlengede fingerben dekket av en tynd, fleksibel hudhinne. Denne spesialiserte vingestrukturen lar dem generere løft og manøvrere gjennom luften med presisjon.
Utover flyvning har flaggermus andre ekstraordinære tilpasninger. Mange arter bruker ekkolokasjon, de sender ut høye frekvenser og tolker de returnerende ekkoene for å navigere og jakte insekter i full mørke. De har også svært utviklet hørsel, som lar dem oppdage de svakeste lydene fra bytte eller hinder.