Hvitrygg ørner, som alle organismer, bruker livsprosessen ekskresjon for å forhindre opphoping av metaboliske avfallsstoffer. Ekskresjon fjerner avfallsprodukter fra kroppen.
Nyrer filtrerer ureum og kreatinin fra blodbanen, sender avfall til kloaken for eliminering som urin. Leveren detoksiserer også skadelige stoffer og produserer galde, som hjelper eliminere avfall gjennom avføring.