Fugler deler evolusjonær avstamning med flere andre dyregrupper. Deres nærmeste levende slektninger er krokodiller, inkludert krokodiller og alligatorer, med hvem de deler en felles forfedre for omtrent 250 millioner år siden.
Fugler er også mer fjernet slektet med skilpadder, slanger, øgler og pattedyr, sporet tilbake gjennom felles forfedre som levde for hundrevis av millioner år siden. Selv om moderne fugler er varmeblodede og fjærklædte, fremhever disse dypere forbindelsene den gamle forgreningen av ryggdyrliv.