Sopp er et rike av organismer som inkluderer gjær, muggsopp og kjøttfulle sopp. De er heterotrofe, noe som betyr at de får sine organiske forbindelser fra andre organismer. Sopp utskiller enzymer som deler ned komplekse organiske stoffer i enklere stoffer som de kan absorbere. Når det gjelder døde dyr, spiller sopp en essensiell rolle i prosessen med nedbrytning ved å bryte ned vev og resirkulere næringsstoffer tilbake i jorden.
Bakterier er encellede mikroorganismer som er prokaryotiske, noe som betyr at de mangler en kjerne- og membranbundne organeller. Bakterier er også heterotrofe og oppnår sine organiske forbindelser fra andre organismer. Noen bakterier er dekomponeringer, noe som betyr at de bryter ned døde organiske materiale, inkludert døde dyr. Disse bakteriene utskiller enzymer som deler ned komplekse organiske stoffer i enklere stoffer som de kan absorbere.
Generelt er sopp bedre egnet for å bryte ned komplekse organiske materialer, for eksempel lignin og cellulose, som er viktige komponenter i plantecellevegger. Bakterier er derimot mer effektive til å bryte ned enklere organiske forbindelser, for eksempel proteiner og sukker.
Derfor, mens både sopp og bakterier lever av døde dyr, spiller de forskjellige roller i nedbrytningsprosessen og har forskjellige evner basert på deres spesifikke enzymer og metabolske veier.