Mississippi er hjem for et mangfold av villliv, inkludert mange arter hjemmehørende i staten:
- Mississippi gopherfrosk — endemisk for Mississippi og federal truet
- Flatwoods salamander — funnet i furuskoger i Mississippi og Alabama
- Pine Woods Snake — funnet i furuskoger i Mississippi og andre sørøstlige stater
- Østlig diamantryggslange — en av verdens største ryggslanger
- Mississippi glente — en medium stor høk med grå kropp og hvit hode
- Rødhodet hackspett — liten svart-hvit hackspett med rød flikk på hodet
- Bachmanspurv — funnet i åpne marker og furuskoger
- Østlig blåfugl — liten blåfugl med rust-rød bryst
- Amerikansk alligator — funnet i sumper, elver og innsjøer
- Golfstør — en stor, forhistorisk seende fisk funnet i Mexicogolfen og dens tilflukter
Dette er bare noen eksempler på de mange dyrene hjemmehørende i Mississippi.