Genetisk mangfold: Kloning produserer genetisk identiske individer. Mangel på genetisk mangfold kan gjøre befolkningen mer utsatt for sykdommer, miljøendringer og andre trusler.
Atferdsmessige og økologiske konsekvenser: Klonede dyr kan mangle naturlig atferd, sosiale strukturer og økologiske interaksjoner utviklet gjennom generasjoner med evolusjon. Dette kan forstyrre økosystemdynamikken.
Konkurranse og ressursutnyttelse: Å introdusere klonede individer kan øke konkurransen om ressurser som mat, habitat og kamerater, og påvirke andre arter.
Smitteoverføring: Klonede dyr kan bære på sykdommer eller genetiske defekter som kan spre seg til ville populasjoner.
Habitategnethet: Klonede dyr er kanskje ikke godt tilpasset de spesifikke forholdene i deres naturlige habitater, noe som fører til lave overlevelsesrater.
Økosystemfunksjon: Fraværet av klonede dyrs økologiske bidrag, som pollinering, frøspredning eller predasjon, kan endre økosystemets funksjon.
Mangel på naturlig utvalg: Kloning omgår naturlig utvalg, noe som eliminerer mindre tilpassede individer. Dette kan resultere i en befolkning som ikke er godt egnet for miljøet.
Uforutsigbare langsiktige effekter: De langsiktige økologiske konsekvensene av kloning og introduksjon av genetisk identiske dyr i et økosystem er ikke fullt ut forstått.
Derfor, selv om kloning av truede arter kan virke som et lovende bevaringsverktøy, bør det tilnærmes med forsiktighet, og grundig forskning er nødvendig for å vurdere potensielle risikoer og påvirkninger på økosystemene.