Capybarer finnes i en rekke habitater over Sør-Amerika:
- Våtmarker som sumper, myrer og elvebredder, der de kan nå akvatiske planter
- Gressmarker inkludert savanner og pampas for beiting
- Regnskoger som tilbyr skjul og diverse matkilder
- Kystområder som mangrove-svømmer og elveutlop