Raserhunder har sine fordeler, men til en pris. Raserhunder opplever et antall helseproblemer som ofte er relatert til overavling. Bedre oppdrettere jobber for å rette opp noen av disse problemene, men mindre seriøse oppdrettere eller valpefabrikker fortsetter med overavling og inavling til skade for hundene.
Beinproblemer
Overavling av hunder kan resultere i beinproblemer i rasen, som notert av Time Magazine. Omtrent 60 prosent av gullretrivere opplever hofteleddsdysplasi, som forårsaker at kuleleddet delvis skyver ut av leddpfannen kontinuerlig. Skyvingen forårsaker smerte og ubehag for hunden, og kan til og med føre til behov for å avlive hunden. Utskliende kneskapar kan også forekomme. Som dysplasi, skjer patellaluksasjon når kneskapen skyver ut av posisjon, forårsakende smerte og betennelse. Begge problemene fører til osteoporose hvis de ikke rettes, ifølge nettsiden Dog Breed Facts.
Immunitets- og blodproblemer
PBS beskriver ulike autoimmunitet- og blodlidelser som kan oppstå på grunn av overavling. For eksempel har bassets og dobermannpinsjere begge en genetisk predisponering for blodkoagulasjonsproblemer; blodet koagulerer ikke riktig, noe som forårsaker blåmerker og blødninger. Bassets er også kjent for å ha primær alvorlig kombinert immunsvikt. Noen raser er utsatt for Addisons sykdom, som påvirker binyrene. Andre hunder, som samojed, pudel og vesthighlandterrier, kan bli rammet av diabetes mellitus. Med denne lidelsen kan hundene ikke riktig behandle karbohydrater og sukkerer.
Hørsel- og synsdefekter
Noen av de mer vanlige genetiske defektene på grunn av overavling påvirker hunderes hørsel og syn. Dalmatinere, som notert av Time Magazine, kan fødes døve eller tape hørselen gradvis. Andre hunder som kan tape hørsel inkluderer engelske settere og australiske cattle dogs. Katarakt kan være et problem blant raser som alaskan malamute, sibirisk husky og bichon frise. Nettsiden Dog Breed Facts oppfører et antall andre øyesykdommer som oppstår som følge av overavling, inkludert ektropion, glaukom og progressiv retinal atrofi. Collie-raser opplever et spesielt navngitt problem kalt collie eye anomaly, hvor retina losnes på grunn av et blodforsyningsproblem, som deretter fører til blindhet i det påvirkede øyet.
Tarm- og hjerteleidelser
Raserhunder som har blitt overavlet, er utsatte for visse tarm-, fordøyelses- og hjerteleidelser. En slik tilstand kalles canine gastric dilatasjon-volvulus, oftere omtalt som oppblåsing (bloat). Maga til hunder som lider av oppblåsing svulmer opp med væsker og gasser. Etterhvert som svullnaden oppstår, vrir maga på stedet; eventuell gass inni blir da fanget og blodforsyningen til de andre fordøyelsesorganene avkjøres. Oppblåsing kan ganske raskt drepe hunder hvis de ikke ruskes til veterinær. Raser påvirket av oppblåsing inkluderer weimaraner, store dansker, greyhunder og andre raser store bryster. En annen lidelse som dreper raskt, er hjertestans. Hunder opplever plutselig hjertestans og dør på stedet i visse tilfeller. Som med oppblåsing, påvirker dette et antall store storebrystede hunderaser.