Forskjellen mellom menn og kvinner styrer mange handlinger og følelser, men hos valper finnes det flere forskjeller mellom kjønnene på overflaten. Hane- og hunnvalper har kjønnsbundne trekk som styrer visse aspekter av bygningen deres. Forskjellene er tydelige allerede som små valper. Det er viktig å merke seg at dette er kun generaliseringer, og det vil alltid finnes unntak fra de fleste regler.
Høyde
Hanevalper av alle raser er generelt høyere enn sine hunn-kolleger. De fleste rasestandarder erkjenner dette ved å ha ulike høydeforventninger for haner og hunner.
Vekt
Selv når haner er like høye som hunner, er hanerne tyngre bygget og veier mer. Haner har typisk større og større beintetthet, så de ser tyngre ut selv om de er like store som hunner. Haner er brede og bredere over hoften og brystet. De har også en tyngre, tykkere hals.
Kjønnsorganer
De eksterne kjønnsorganene er synlig forskjellige mellom kjønnene. Hanhundens penis strekker seg midtveis ned buken. Hunnens vulva ligger rett under analåpningen.
Sykluser
En svært tydelig forskjell i fysiske karakteristika mellom hane- og hunnvalper er hunnens syklus. Det er ingen forskjell mellom raser, størrelser eller noe annet med denne forskjellen: Alle hunnvalper som ikke er sterilisert opplever brunstsykluser. En hunnvalp vil komme i "brunst" i ca. to uker, en gang hvert 6. til 8. måned. I denne perioden vil hun vise seksuell lyst, og ha blodig utflod fra vulvaen.
Helse
Forskjellene i helse mellom hane- og hunnvalper varierer innenfor raser. I noen raser har hunnen mer tendens til visse sykdommer. I andre raser er hanen mer sannsynlig å ha fysiske problemer. For eksempel er haner av tysk sjåhundrasen generelt mer utsatt for hofteleddsdysplasi. Forskjeller kan også avhenge av typen sykdom eller lidelse i spørsmål. For en virkelig forståelse av sykdoms- eller lidelsessannsynlighet, er det best å sjekke spesifikasjonene for rasen du ønsker.