Eubakterier, eller «ekte bakterier», er en utrolig divers gruppe prokaryotiske mikroorganismer funnet i nesten hvert habitat på jorden – fra dype hav til varme kilder og frossen tundra.
De mangler kjernemembran og organeller. Deres DNA flyter fritt i en sirkulær kromosom, og de har strukturer som pili, flageller, ribosomer og plasmider.
Eubakterier reproduserer raskt gjennom binær fissjon, iblant deler de seg hvert 20–30 minutt. De spiller vitale økologiske roller i nedbryting, nitrogenbinding, fotosyntese og elementkretsløp. Økonomisk og medisinsk brukes de til å produsere antibiotika og enzymer, men noen forårsaker infeksjonssykdommer.
Eubakterier er essensielle for jordens biodiversitet og påvirker medisin, bioteknologi og miljøvitenskap.