1. Habitattap
Skogaverk og arealomsatting for jordbruk, skogbruk og urbanisering reduserer de store territoriene jaguarer trenger.
2. Jakt
Jaguarer jaktes for pels, tenner og kroppsdelar solgt på sortemarked for tradisjonell medisin og luksusvarer.
3. Konflikt med mennesker
Jaguarer som rov husdyr drepes ofte i hevn eller av frykt for menneskers sikkerhet.
4. Klimaendringer
Endrede klimaer påvirker jaguarhabitater og byttetilgang, gjør overlevelse og reproduksjon vanskeligere.
5. Manglende genetisk mangfold
Populasjonsfragmentering og inavling reduserer genetisk mangfold, øker sykdomsmottagelighet og senker tilpasningsevne.
6. Illegal handel
Jaguarer og deres deler smuggles illegalt til dyrparker, private samlere og tradisjonell medisin.