Naturlig seleksjon gjør begge deler. Ettersom den favoriserer visse alleler, reduserer den variabiliteten ved at gener med disse allelene overtar reproduksjonen over gener uten dem.
På den andre siden, fordi seleksjon virker uavhengig på mange lokuser, kan den også øke heterozygoti og allelmangfold, og øke artsnivåets genetiske variasjon. Dette tillater populasjoner å bedre tilpasse seg skiftende miljøer.