Jaguarer foretrekker tett vegetasjon med tilgang til vannkilder, ettersom de er dyktige svømmere og ofte jakter og drikker i nærheten av vannforekomster. De etablerer hjemmekontrakter som varierer i størrelse avhengig av tilgjengeligheten av byttedyr, men hannenes områder kan dekke flere hundre kvadratkilometer.
Innenfor deres naturtyper spiller jaguarer avgjørende økologiske roller som topp rovdyr, og hjelper til med å opprettholde økosystemets balanse ved å regulere byttedyrpopulasjoner. De er ensomme dyr og okkuperer ofte naturtyper med forskjellige byttedyr, som hjort, peccaries, capybaras, tapirs og mange andre.
Bevaringsinnsats for jaguarer innebærer å bevare og beskytte deres naturtyper for å sikre langsiktig overlevelse av disse praktfulle og økologisk viktige feline-rovdyrene.